Российские и зарубежные ученые открыли более 130 тыс. РНК-вирусов

Алгоритм быстрого анализа геномных баз данных, разработанный российскими и зарубежными учеными, позволил открыть более 130 тыс. РНК-вирусов. Об этом 31 января сообщили в пресс-службе Санкт-Петербургского государственного университета СпбГУ.

Ведущий научный сотрудник СпбГУ Дмитрий Мелешко пояснил, что ученым удалось создать «очень точное и чувствительное „сито“ для обработки огромных количеств геномных данных». По его словам, это сузило масштабы данных по РНК-вирусам и, соответственно, дало возможность быстрее их обрабатывать.

«Мы бы хотели идентифицировать к концу десятилетия более 100 миллионов РНК-вирусов», — поделился планами ученых Мелешко.

Алгоритм, который разработали российские и зарубежные ученые, работающие в рамках научной коллаборации Serratus, позволяет быстро анализировать геномные базы и находить следы вирусной РНК. Этот подход можно применять для обнаружения вирусов, похожих на грипп или коронавирус.

Ученым удалось создать этот алгоритм благодаря обнаружению особого участка внутри фермента RdRp, который ответственен за размножение РНК-вирусов. Выяснилось, что в кодирующем этот белок гене есть последовательность, общая для всех вирусов. Именно это позволило выработать алгоритм быстрого анализа больших геномных баз и выявлять следы генома любых РНК-вирусов.

В результате применения этого подхода ученые уже открыли порядка 130 тыс. РНК-вирусов. Это в десять раз больше, чем было известно ранее.