Индийские ученые разработали тест для оспы обезьян на основе CRISPR/Cas12
Геномный редактор CRISPR/Cas12 адаптировали для создания экспресс-теста на вирус оспы обезьян индийские молекулярные биологи. Об этом свидетельствуют результаты опыта, которые опубликованы 24 октября в электронной библиотеке medRxiv.
Тест позволяет выявить инфекцию почти со 100%-ной точностью за несколько десятков минут после сбора информации.
После начала пандемии COVID-19 ученые начали разрабатывать подходы, которые позволяют быстро и дешево выявлять следы конкретных вирусов в биологических жидкостях пациентов и в природных и городских средах. Например, биологи из США приспособили геномный редактор CRISPR/Cas12 для поиска следов различных штаммов коронавируса в образцах слюны пациентов.
Индийские же ученые под руководством Девашиша Рата, руководителя группы в Центре атомных исследований имени Хоми Баба в Тромбее (Индия), использовали данную вариацию, чтобы создать экспресс-тест на следы присутствия в биообразцах частиц вируса MPXV, которые вызывают вирусную оспу обезьян.
Чтобы разработать систему тестирования,ученые решили исследовать и сравнить между собой структуру polA, ключевого гена вирусов оспы, который отвечает за подготовку новых копий ДНК этих патогенов. По результатам исследования удалось выделить небольшой кусочек в этом гене, уникальный для MPXV и обладающий иной структурой в геноме остальных представителей рода Orthopoxvirus.
Затем индийские ученые решили модифицировать РНК и белковые компоненты редактора CRISPR/Cas12 таким образом, чтобы они начали соединяться с участком гена polA и вырабатывать светящиеся молекулы. Генетики работу этой системы проверили на растворах, которые содержат смесь из частиц MPXV, а также нескольких других вирусов оспы.
Результаты опытов показали, что модифицированная версия CRISPR/Cas12 очень быстро фиксировала следы вируса в образцах даже в тех случаях, когда в них содержалось несколько десятков полных копий или обрывков генома MPXV.
Такой же результат получился и при добавлении в раствор частиц вирусов оспы птиц и других представителей рода Orthopoxvirus, что делает данную систему особенно перспективной для выявления носителей вирусной оспы обезьян в регионах, где распространяются несколько разновидностей этих патогенов.
