Новая технология помогла найти антибиотик в слюне медведя
Разработанная российскими учеными новейшая технология анализа микроорганизмов позволила обнаружить в слюне медведя мощный антибиотик. Об этом сообщает 4 сентября научное издание PNAS.
Команда российских ученых, главенствующую роль в которой играли сотрудники лаборатории Александра Габибова из московского Института биоорганической химии имени академиков Шемякина и Овчинникова и их коллеги из Сколтеха, разработала новый метод, позволяющий быстро выявлять функциональные характеристики микроорганизмов. Суть метода заключается в том, что бактерии сперва «упаковываются» в капли водно-жировой эмульсии, которые помещаются на специальную платформу. В таких каплях микроорганизмы могут какое-то время жить и размножаться. Затем экспериментаторы проводят автоматическую сортировку капель на присутствие либо отсутствие маркерных флуоресцентных белков, иначе называемых белками-репортерами. Такая быстрая сортировка позволяет просмотреть до 30 тысяч капель в секунду, что невероятно упрощает изучение взаимодействия между различными видами микробов и дает возможность отобрать бактерии с искомыми свойствами.
Разработанная технология была применена для анализа бактерий, живущих в ротовой полости сибирского бурого медведя — Ursus arctos collaris. Ученые хотели узнать, есть ли среди данных бактерий микроорганизмы, способные подавлять размножение патогенной бактерии золотистого стафилококка Staphylococcus aureus. Для этого микроорганизмы из пасти медведя были помещены в капли вместе с бактериями стафилококка, которые несли ген флюоресцентного белка. При пролиферации стафилококка накопленные в капле флюоресцентные белки начинали во время анализа светиться зеленым светом. Исследователи же отобрали те капли, которые не светились, ибо рост Staphylococcus aureus в них был подавлен микроорганизмами из пасти медведя.
Подобная стратегия позволила выявить противомикробный штамм Bacillus pumilus, продуцирующий антибиотик амикумацин А. И хотя науке уже был известен данный антибиотик, дополнительное исследование позволило обнаружить также и новый ген устойчивости к нему, кодирующий фермент киназу, инактивирующую амикумацин.
Напомним, что золотистый стафилококк — это грамположительная бактерия, имеющая форму сферы или овала. Это самый патогенный вид стафилококков для человека. Он до сих пор является одной из четырех наиболее частых причин внутрибольничных инфекций, и борьба с ним требует значительных средств. Например, совсем недавно в Австралии было выявлено три штамма стафилококка, устойчивых ко всем антибиотикам.
