Систему быстрого анализа мутаций SARS-CoV-2 разработали в Японии
Более быструю и простую систему анализа мутаций в SARS-CoV-2 разработали исследователи из университетов Осаки и Хоккайдо, 1 апреля сообщает журнал Cell Reports.
Современные методы изучения мутаций SARS-CoV-2 очень сложны и трудоемки, поскольку коронавирусы имеют большие геномы. Японские ученые разработали быструю систему обратной генетики на основе ПЦР для анализа мутаций SARS-CoV-2.
Эта система использует полимеразную цепную реакцию (ПЦР) и круговую полимеразную реакцию расширения (КПРР) для реконструкции полноразмерной кДНК вирусного генома.
Процесс не включает в себя использование бактерий, которые могут внести дальнейшие нежелательные мутации, и занимает всего две недели, используя простые шаги для генерации инфекционных вирусных частиц. Предыдущие методы занимали пару месяцев и подразумевали очень сложные процедуры.
«Этот метод позволяет нам быстро изучить биологические особенности мутаций в SARS-CoV-2. Мы можем использовать метод КПРР для создания рекомбинантных вирусов с каждой мутацией и исследовать их биологические особенности в сравнении с родительским вирусом», — говорит ведущий автор исследования Шихо Тории.
Новый метод КПРР будет способствовать пониманию механизмов, лежащих в основе распространения и патогенеза SARS-CoV-2, а также поможет определить биологическую значимость возникающих мутаций
Это может ускорить разработку новых терапевтических и профилактических мер для COVID-19.