Ученые обнаружили иммунные клетки, которые повышают риск смерти от COVID-19
Специфические типы иммунных клеток, связанные с повышенным риском смерти от COVID-19, обнаружили исследователи Йельского университета, 28 февраля сообщает Phys.org.
Известно, что клетки иммунной системы, такие как Т-клетки и В-клетки, продуцирующие антитела, обеспечивают широкую защиту от патогенов. А крупномасштабный анализ данных о миллионах клеток дал ученым широкий обзор реакции иммунной системы на SARS-CoV-2. Однако ученые также обнаружили, что некоторые реакции иммунных клеток, в том числе с помощью типов клеток, которые обычно являются защитными, иногда могут вызывать смертельное воспаление и смерть у пациентов.
Ученые разработали систему машинного обучения PHATE, которая позволяет просматривать данные с разным уровнем детализации, от миллионов клеток до одной клетки, в течение нескольких минут.
«Алгоритмы машинного обучения обычно фокусируются на представлении данных с одним разрешением, игнорируя информацию, которую можно найти в других, более сфокусированных представлениях. По этой причине мы создали многомасштабный PHATE, который позволяет пользователям увеличивать масштаб и фокусироваться на определенных подмножествах своих данных для выполнения более детального анализа», — сказал Маник Кучру, докторант Йельской медицинской школы.
Ученые проанализировали 55 миллионов клеток крови, взятых у 163 пациентов, поступивших в больницу Йельского университета в Нью-Хейвене с тяжелыми случаями COVID-19. Они обнаружили, что высокие концентрации Т-клеток, по-видимому, защищают от неблагоприятных исходов, в то время как высокие уровни двух типов лейкоцитов, известных как гранулоциты и моноциты, сопутствуют более высоким уровням смертности.
Однако, более детальный анализ показал, что высокое содержание TH17, вспомогательной Т-клетки, также коррелирует с более высокой смертностью в сочетании с клетками иммунной системы IL-17 и IFNG.
Измеряя количество этих клеток в крови, ученые могли бы предсказать, будет ли пациент жить или умрет с точностью 83%.