Ученые применили CRISPR для анализа крови на антитела
Технологию генетической модификации CRISPR для идентификации антител в образцах крови пациентов адаптировали ученые из Гарвардской медицинской школы, 13 августа сообщает журнал Molecular Cell.
Технология задействует настраиваемые коллекции белков, которые присоединены к Cas9, белку, лежащему в основе технологии CRISPR. Когда эти слитые с Cas9 белки наносятся на микрочип, содержащий тысячи уникальных молекул ДНК, каждый белок в смеси будет самособираться в положение на чипе, содержащем соответствующую последовательность ДНК.
Исследователи назвали этот метод «PICASSO», сокращенно от «иммобилизация пептидов путем самоорганизации, опосредованной Cas9». Затем, применяя образец крови к микрочипу PICASSO, можно идентифицировать белки на микрочипе, которые распознаются антителами пациента.
«С помощью нашей новой технологии вы размещаете молекулы ДНК в определенных местах на поверхности, и каждый белок из смеси затем самостоятельно собирается в соответствующую последовательность ДНК, как автоматический набор по номерам. Полученные в результате ДНК-шаблонные белковые микрочипы позволяют быстро идентифицировать антитела в клинических образцах, которые распознают любые интересующие вас белки», — сказал доктор Барбер.
Исследовательская группа продемонстрировала, что технология работает для сборки тысяч различных белков. Ее можно легко адаптировать в качестве медицинского диагностического инструмента широкого спектра действия.
В работе была использована методика для обнаружения антител патогенов, включая SARS-CoV-2, из крови выздоравливающих пациентов с COVID-19.