Немецкие ученые смогли ускорить генетический анализ вирусов

Программное обеспечение, которое значительно ускоряет генетический анализ вирусов, разработали исследователи из Йенского университета имени Фридриха Шиллера совместно с международными партнерами, 15 мая пишет немецкая газета Oldenburger Onlinezeitung.

По данным издания, инструмент, получивший название Vclust, позволяет в течение нескольких часов проанализировать миллионы вирусных геномов и сгруппировать их по сходству, что решает проблему не хватки эффективных методов для надежного сравнения и классификации огромных объемов данных, полученных в результате метагеномики.

Сообщается, что Vclust реализует три компонента: распознает похожие геномы, рассчитывает генетическое соответствие и автоматически сортирует геномы по группам. Полученные результаты хорошо согласуются с официальной классификацией вирусов, добавили в университете.

Отмечается, что программное обеспечение доступно с открытым исходным кодом и может быть использовано через веб-сервис. В будущем оно может сыграть важную роль в каталогизации новых вирусов и в медицинских исследованиях. По информации газеты, проект финансировался, в частности, кластером передового опыта «Баланс микровселенной» Йенского университета.