Доступно первое геномное секвенирование обезьяньей оспы из Швейцарии
Женевский центр новых вирусных заболеваний поделился первыми результатами секвенирования генома обезьяньей оспы, 30 мая сообщает Мedicalxpress.
Ученые Центра сделали важный шаг, который позволит провести дальнейший анализ и сравнение генома вируса из Швейцарии с последовательностями генома из других стран. Согласно предварительным результатам, вирусная последовательность первых двух случаев в Швейцарии генетически связана со случаями, зарегистрированными в нескольких других странах в контексте текущей вспышки.
Четыре случая оспы обезьян были подтверждены с помощью ПЦР-теста в Швейцарии вирусологической лабораторией HUG, входящей в состав CRIVE (национальная справочная лаборатория новых вирусов), которому Швейцарское федеральное управление общественного здравоохранения (FOPH) поручило отслеживать события такого типа.
Эти случаи являются частью более крупной и необычной вспышки, которая продолжается во многих странах Европы, Южной и Северной Америки и Австралии, где, по данным ВОЗ, подтверждено более 400 случаев с момента сообщения о первом случае.
Вирус можно идентифицировать с помощью ПЦР-теста, особенно в пораженных участках и других образцах. Диагноз на сегодняшний день основан на тестах, разработанных специализированными лабораториями, такими как лаборатория в Женеве.
Центр CRIVE внимательно следит за ситуацией и доступен для всех диагностических запросов, связанных с этой вспышкой.
Напомним, что секвенирование (белков и нуклеиновых кислот — ДНК и РНК) — определение их аминокислотной или нуклеотидной последовательности. В результате получают формальное описание первичной структуры линейной макромолекулы в виде последовательности мономеров в текстовом виде. Секвенирование используется в молекулярной биологии для изучения геномов и белков, которые они кодируют. Информация, полученная с помощью секвенирования, позволяет исследователям выявлять изменения в генах, ассоциации с заболеваниями и фенотипами, а также выявлять неизвестные ранее последовательности нуклеиновых кислот, например, геномы нового типа.
