Стартап из США создал уникальную коллекцию штаммов для биопрепаратов
Большая коллекция микроорганизмов, собранная в различных средах, имеется в распоряжении AgBiome, стартапа из США, к которому недавно присоединился бывший генеральный директор Bayer Марджин Деккерс. Среди штаммов коллекции выделяют те организмы, которые могут помочь в замене агрохимии на биологические препараты. Об этом 3 июня рассказал генеральный директор AgBiome Эрик Вард в интервью главному редактору издания AFN.
«У нас есть большая запатентованная коллекция микробов, которую мы собрали из самых разных сред по всему миру. В первую очередь в США, мы также собрали значительную часть коллекции в Африке через партнерские отношения, которые мы развили в контексте грантов Гейтса, которые у нас есть от Фонда Билла и Мелинды Гейтс», — рассказал Вард.
«А потом мы начали делать полное секвенирование генома каждого из этих микробов. Таким образом, мы знаем практически все содержание генов каждого штамма, который мы собрали. Вся эта информация входит в довольно сложную архитектуру данных, которая в значительной степени бесконечно масштабируема и позволяет нам делать с очень высокой скоростью сравнение всего генома среди любых организмов в коллекции. Включая любые новые, которые приходят, мы можем искать сходство по всей коллекции», — продолжил он.
Вард рассказал, что данная методика позволяет создавать биологические препараты, которые по своим свойствам похожи на химические средства.
«Когда мы идентифицируем штамм, который выглядит так, будто он обладает интересным свойством, например, убивает болезнь или способен контролировать насекомое, мы очень быстро идентифицируем штаммы, тесно связанные с ним. И ищем локальный оптимум вокруг этой начальной находки, чтобы характеристики были очень похожи на то, что вы сделали бы в традиционном химическом препарате», — рассказал он.
«Всё это работает, потому что у нас есть проверенная парадигма скрининга в лаборатории, где мы можем очень точно провести контроль над реальными агрономическими вредителями и болезнями, которые важны в полевых условиях, что с высокой воспроизводимостью переводится в активность в полевых условиях. Поэтому, когда мы видим что-то в лаборатории, мы можем быть совершенно уверены, что получим хороший результат и в полевых условиях», — сообщил Вард.
