В Бразилии создан банк бактериальных геномов для поиска биопестицидов
Банк бактериальных геномов для создания биопестицидов создан бразильской компанией Agrivalle в партнерстве с Технологическим центром химической и текстильной промышленности (SENAI CETIQT). Об этом 24 октября пишет издание Agropages.
Партнеры провели совместные исследования по секвенированию, сборке и аннотации бактериальных штаммов для разработки биологических решений для борьбы с вредителями и болезнями.
«Мы можем представить микроорганизмы как устройство, имеющее исходный код с различной информацией. Ее изучение помогает нам лучше понять, как оно работает, и его неизвестные характеристики. Это может привести нас к новым путям применения микроорганизмов», — пояснил Айрон Аморели, исследователь Agrivalle.
По его словам, с помощью этой информации можно также понять «механизмы действия и разработать новые технологии, а также другие возможности биотехнологического применения данного микроорганизма».
По его словам, проект имел большое значение из-за его потенциала для генерации, визуализации и применения генетической информации. Имея полный геном бактерии, исследователь мог получить доступ к этой информации для более эффективного создания и разработки решений для данной области.
Он отметил, что это исследование обеспечит большую скорость разработки биопестицидов. При наблюдении за характеристикой вредителя или болезни стало достаточно поискать в банке культур изучаемые микроорганизмы, которые могут представлять идеальную комбинацию для решения, и выполнить более гибкие тесты на активной фазе поиска.
«Мы набрали скорость и набрали обороты. Этот тип проверки характеристик биотехнологического потенциала значительно упрощает работу, когда мы собираемся разработать новое доказательство концепции, продукта или решения в дополнение к новым открытиям», — заявила Изабелла Китано, исследователь Agrivalle.
В конце концов, сказала она, более внимательное изучение всей цепи ДНК бактерии и микроорганизма могло бы стать «ключом к обнаружению особенностей, которые без этого исследования мы никогда бы не узнали». Кроме того, геномная информация открывает поле для исследований в области редактирования генов и синтетической биологии, которые являются территориями инноваций, разрабатываемых компанией.
Agrivalle объявила, что у нее уже есть геном шести микроорганизмов, но есть планы по расширению за счет партнерства, подобного тому, что было с SENAI CETIQT, для создания платформы и более оптимизированного расширения геномной информации банка. И поэтому цель состояла в том, чтобы в ближайшие год-два увеличить количество геномов в четыре раза.
Как пояснил Аморели, для составления полного бактериального профиля может потребоваться почти шесть месяцев. «И именно поэтому на нашем новом этапе проекта, который находится в стадии реализации, в ближайшие месяцы мы будем изучать более 15 линий в маршрутах секвенирования», — заключил исследователь.