В мировом океане ученые нашли 5500 новых видов РНК-вирусов
Более 5500 новых видов РНК-вирусов обнаружили ученые в мировом океане с помощью машинного обучения, 7 апреля сообщает Phys.org.
Самая многочисленная коллекция недавно выявленных видов РНК-вирусов принадлежит к типу под названием Taraviricota.
«РНК-вирусы, безусловно, важны в нашем мире, но обычно мы изучаем лишь крошечную их часть — несколько сотен, которые наносят вред людям, растениям и животным. Мы хотели систематически изучать их в очень больших масштабах и исследовать окружающую среду, в которую никто не заглядывал глубоко, и нам повезло, потому что практически каждый вид был новым, и многие из них были действительно новыми», — сказал профессор Мэтью Салливан из Университета штата Огайо.
В то время как микробы вносят существенный вклад в развитие всей жизни на планете, вирусы, которые заражают их или взаимодействуют с ними, оказывают различное влияние на функции микроорганизмов. Считается, что эти типы вирусов выполняют три основные функции: убивают клетки, изменяют то, как инфицированные клетки управляют энергией, и переносят гены от одного хозяина к другому.
По словам исследователей, знание большего разнообразия и численности вирусов в мировом океане поможет объяснить роль морских микробов в адаптации океана к изменению климата. Океаны поглощают половину вырабатываемого человеком углекислого газа из атмосферы, и предыдущие исследования этой группы показали, что морские вирусы являются «регулятором» биологического насоса, влияющего на то, как накапливается углерод в океане.
Анализ ученых выявил тысячи видов РНК-вирусов, которые они сгруппировали в пять новых предложенных типов: Taraviricota, Pomiviricota, Paraxenoviricota, Wamoviricota и Arctiviricota, которые, как и Taraviricota, представлены очень многочисленными видами, по крайней мере, в критически важных для климата водах Северного Ледовитого океана.
Ученые уже давно каталогизировали виды ДНК-вирусов в океанах, увеличив их число с нескольких тысяч в 2015 и 2016 годах до 200 000 в 2019 году. Для этих исследований ученые имели доступ к вирусным частицам, чтобы завершить анализ.
В этих текущих попытках обнаружить РНК-вирусы не было вирусных частиц для изучения. Вместо этого исследователи извлекли последовательности из генов, экспрессируемых в организмах, плавающих в море, и сузили анализ до последовательностей РНК, которые содержали сигнатурный ген, называемый RdRp, который эволюционировал в течение миллиардов лет в РНК-вирусах и отсутствует в других вирусах или клетках.
В целом, полученные результаты побудили исследователей предложить не только пять новых типов, но и по меньшей мере 11 новых орторнавиранных классов РНК-вирусов.
«Предполагается, что RdRp является одним из самых древних генов — он существовал до того, как возникла необходимость в ДНК, — сказал Ахмед Зайед из Университета штата Огайо. — Таким образом, мы не просто прослеживаем происхождение вирусов, но и прослеживаем происхождение жизни».
