Технологию определения типов клеток разработали в Институте Солка
Новую геномную технологию для одновременного анализа ДНК, РНК и хроматина в одной клетке разработали исследователи Института Солка, 9 марта сообщает Phys.org.
«Эта мультимодальная платформа будет полезна, предоставляя всеобъемлющую базу данных, которая может быть использована группами, пытающимися интегрировать свои данные в одном режиме. Эта новая информация также может служить основой и руководством для будущей классификации типов клеток», — говорит Джозеф Экер, директор Лаборатории геномного анализа в Солке.
В методе, получившем название snmCAT-seq, ученые использовали биомаркеры для маркировки ДНК, РНК и хроматина. Это позволило исследователям определить все три типа молекулярной информации в одной и той же клетке.
Затем ученые использовали этот метод для идентификации 63 типов клеток в области лобной коры человеческого мозга и провели сравнительный анализ эффективности вычислительных методов для интеграции нескольких одноклеточных технологий.
Они обнаружили, что вычислительные методы обладают высокой точностью при определении широкого спектра популяций клеток головного мозга, но результаты не всегда однозначны при анализе четко определенных типов клеток. Это говорит о том, что необходимо проводить другие типы измерений для более точной классификации клеток.
Ученые считают, что этот метод будет востребован для разработки Каталога переписи клеток, разрабатываемого в Национальном институте здравоохранения по изучению мозга. Основной задачей инициативы «МОЗГ» является разработка каталогов типов клеток мозга мыши и человека.
Также эти результаты могут быть использованы для лучшего понимания того, как растет и развивается мозг, а также роли, которую различные типы клеток играют в нейродегенеративных заболеваниях, таких как болезнь Альцгеймера.
