В Санкт-Петербурге разработали алгоритм сборки генома коронавирусов

Ученые-биоинформатики Санкт-Петербургского государственного университета разработали сборщик геномов коронавирусов, 6 июля сообщила пресс-служба университета.

«Новая разработка Центра алгоритмической биотехнологии СПбГУ, получившая название coronaSPAdes, позволяет собирать геномы РНК-вирусов, и в первую очередь коронавирусов. По предварительным данным, с ее помощью уже удалось восстановить последовательности геномов ранее неизвестных коронавирусов», — сообщили в университете.

Как сообщается, алгоритм coronaSPAdes — это режим работы еще одной разработки СПбГУ — сборщика генома SPAdes (Saint Petersburg Assembler).

Сборщик SPAdes позволяет производить расшифровку геномов живых организмов.

Ученые отметили, что в генной инженерии существует проблема выстраивания последовательности генов. Ученые используют специальные системы для связи отдельных элементов расшифрованного генома в единую цепь:

«сборка генома мало чем отличается от сборки пазла из миллиона частей. Эта задача относится к одной из самых сложных алгоритмических проблем в биоинформатике, и, чтобы ее решить, необходимо использовать специальные инструменты — геномные сборщики».